海南航空托运宠物的费用根据航线计重方式不同而有所差异，具体收费标准如下：
计重制航线：宠物重量、其托运宠物箱及携带食物的总重量，均不计算在免费行李额内，应按照超限行李进行收费。每千克收费标准为单程直达经济舱普通票价的 1.5%，收费总重量为宠物及宠物箱、食物总重量，尾数四舍五入。例如，宠物和相关物品总重 10 千克，单程直达经济舱普通票价为 1000 元，那么托运费用为 10×(1000×1.5%)=150 元。
计件制航线：根据每个容器总重量（包含容器中小动物及水与食物的重量）来收费。2 千克≤小动物行李≤8 千克时，收费 3600 元人民币或 500 美元或 480 欧元或 700 加元；8 千克 < 小动物行李≤23 千克时，收费 4900 元人民币或 700 美元或 660 欧元或 960 加元；23 千克 < 小动物行李≤32 千克时，收费 7800 元人民币或 1100 美元或 1050 欧元或 1530 加元。需注意，容器的可运输体积不得超出 121×81×88 厘米的范围，且每个容器总重量＞32 千克时不允许作为行李托运。
此外，如果选择让宠物进客舱，每个航段每只宠物收费 1399 元。同时，若旅客为托运的宠物办理声明价值（海航国内航班，且须能提供相关证据表明宠物实际价值超过 100 元 / 千克），应支付声明价值附加费，按照旅客声明的每千克价值超过人民币 100 元限额部分价值的 5‰收取。
