除了DNA鉴定，还可以通过以下几种方法进行亲子鉴定：
血型鉴定：根据红细胞ABO血型系统和Rh血型系统进行鉴定。例如，如果父亲为RH阴性血，则孩子也是RH阴性血的概率较大；若父亲为RH阳性血，则母亲必然是RH阳性血，所以孩子的血型只能是RH阳性血1。
人类染色体异常克隆体检测：需要对受试者的精子或卵子发生突变产生异常克隆体的情况加以判断，从而推断亲缘关系。具体而言就是将受精卵培养至显微镜下观察分裂中期的染色体，如出现两个X染色体则可确认其母系来源，即为亲缘关系鉴定提供依据1。
DNA指纹：指具有完全个体特异的DNA多态性，其个体识别能力足以与手指指纹相媲美，因而得名。可用来进行个人识别及亲权鉴定，同人体DNA的酶切片段杂交，获得了由多个位点上的等位基因组成的长度不等的杂交带图纹，这种图纹极少有两个人完全相同，故称为DNA指纹2。
STR检测（短串联重复序列）：又称微卫星DNA，是一类广泛存在于人类基因组中的DNA多态性基因座。它由2~6碱基对构成心序列，呈串联重复排列。STR基因位点长度一般在100～300bp之间。因其基因片段短、扩增效率高、准确等特点，被称作第二代DNA指纹，近几年亲子鉴定多采用该方法2。
SNP：成为代遗传标志，人体许多表型差异、对或疾的易感性等等都可能与snp有关2。
RFLP分析：限制图谱标记和可见表型重组频率是可测量的，将遗传图谱分为基因型和表型两种分子标记。限制标记成为分子水平上测定遗传基因的有力工具，也是因为它不受对表型有影响的基因组变化。RFLP和SNP是连锁图谱的基础，对于亲子鉴定具有重要的意义
需要注意的是，以上提到的方法都有其局限性，可能无法像DNA鉴定那样提供高准确性的结果。此外，这些方法也可能受到各种因素的影响，如样本质量、实验技术、数据分析等。因此，在实际应用中，建议选择正规的鉴定机构进行DNA亲子鉴定，以确保结果的准确性和可靠性。
二、 仍在特定情况下使用的辅助方法这些方法不能作为亲子关系的直接证据，但可以作为佐证或用于其他目的的年代推断。
出生时间推断
女性的排卵期可能提前或推后，受孕日期本身就是一个估算值。
这只能证明“有可能”，是间接证据，无法直接证明生物学关系。
原理：通过核对母亲的受孕时间、妊娠时间和分娩日期，来判断被怀疑的男性在关键时间点是否有可能与母亲在一起。
缺点：
现状：在法律诉讼中可作为辅助的时间线证据，但不能作为决定性证据。
三、 现代DNA技术的不同形式当您说“除了DNA”时，可能特指需要抽血或特殊采集的DNA测试。但实际上，现代DNA鉴定技术本身也非常多样化：
常规样本DNA鉴定：使用血液、口腔拭子（用棉签刮取口腔黏膜细胞）等。这是标准的方式。
特殊样本DNA鉴定：技术的发展使得即使没有血液也能进行DNA检测，准确率同样，包括：
带毛囊的头发（必须是拔下来的，剪下来的不行）
指甲
用过的牙刷、口香糖、烟头
精斑、血迹（在法医学中常用）
胎儿亲子鉴定：通过孕妇静脉血（无创产前亲子鉴定）或羊水穿刺、绒毛膜穿刺来获取胎儿的DNA信息与疑父对比。
