孕妇在孕早、中、晚不同阶段做胎儿亲子鉴定，若选择同一种合规技术且流程规范，准确率无本质差异，均能达 99.99% 的行业标准，与孕期阶段无关。
从技术原理看，胎儿 DNA 在受精卵形成时已确定，不会随孕期变化。孕早期通过绒毛穿刺获取的绒毛组织，与胎儿基因 同源；孕中期羊水穿刺采集的羊水含胎儿脱落细胞，携带完整胎儿 DNA；孕晚期主流的无创静脉血鉴定，虽孕早期胎儿游离 DNA 占比 3%-5%，低于孕晚期的 10%-20%，但现代高通量测序技术可通过检测上万 SNP 位点，捕获胎儿 DNA，确保准确率。
不过，部分非孕期因素可能影响结果。如绒毛或羊水穿刺操作不当混入母体细胞，无创静脉血采集时混入他人血液，会导致样本污染；选择无资质机构，因设备落后、检测位点不足，也会降低准确率；孕妇若有嵌合体、接受过器官移植等特殊情况，可能干扰无创检测，但正规机构会提前询问病史规避风险。
综上，孕期选择胎儿亲子鉴定的核心是性而非准确率。孕早、中期优先选无创静脉血，避免穿刺流产风险；孕晚期无创检测更稳定，无需担忧准确率。