环境洁净等级方面，核心区域（DNA 提取、扩增、测序区）需达 ISO 8 级标准，每立方米≥0.5μm 微粒不超过 352,000 个；样本制备等高精密区域需达 ISO 7 级（≤35,200 个）。通过初效、中效、三级过滤的空气净化系统实现控制，确保空气单向流动，室内保持 5-10Pa 正压，防止外界污染渗入。
设施布局上，需严格划分试剂准备、样本处理、扩增、产物分析等独立区域，各区物理隔断并单向流转。核心区配备 Ⅱ 级及以上生物柜，每 6 个月检测风速和过滤效率；地面、墙面用耐腐蚀无缝材料，墙角圆弧处理；实验台配万向排气罩处理废气。
清洁执行日常与深度双重标准：每日用 75% 酒精或 500mg/L 次氯酸钠台面，每周紫外灯照射≥30 分钟；每月清洁更换过滤器，每季度无死角。试剂耗材经处理，通过专用传递窗紫外后传入。
人员操作要求严格：进入洁净区需换专用洁净服，操作中全程戴手套，每小时或换样本时更换。严禁室内饮食，样本操作避免气溶胶产生，废弃物高压后处理。核心设备每年校准，移液器每月检测精度。
监测控制需建立定期制度：每月测微粒浓度，每季度监测温湿度（18-26℃，40%-60%）和压差，数据存档。通过阳性、阴性、空白对照验证环境有效性，确保符合《司法鉴定程序通则》规范。