一、样本相关问题
1、样本污染
样本采集过程中接触外来 DNA（如他人血液、唾液、皮肤细胞）可能导致污染。例如，采集口腔拭子时未清洁手部，或使用非无菌工具；处理毛发样本时接触他人毛囊细胞；血液样本与其他样本交叉污染等。污染会引入额外基因信息，干扰分型结果。
2、样本降解或质量不足
样本保存不当易导致 DNA 降解，如血液样本未冷藏、暴露于高温潮湿环境；毛发样本无毛囊（仅毛干不含核 DNA）；陈旧烟头、口香糖等特殊样本因 DNA 含量低或降解严重，可能无法有效提取完整基因片段，导致分型失败或数据不全。
3、样本错误标记
个人隐私鉴定中自行采集样本时，若标记混乱（如混淆父母与孩子的样本），或邮寄过程中样本包装破损、标签脱落，会直接导致结果与实际关系不符。
二、实验操作失误
1、实验流程不规范
实验室若未严格遵循标准化操作，可能引入误差。例如，DNA 提取时试剂配比错误导致提取效率低；PCR 扩增阶段引物设计不合理、退火温度偏差，或扩增循环数异常，可能引发非特异性扩增，产生假阳性条带。
2、设备故障或校准问题
毛细管电泳仪等核心设备若未定期校准，可能导致 DNA 片段长度判读错误；检测软件版本过时或参数设置不当，会影响等位基因分型的准确性，尤其对低峰信号的识别易出现偏差。
3、人为操作疏漏
实验人员在样本编号、移液操作中出现疏忽（如样本交叉混淆、加样量错误），或数据分析时误读电泳图谱，可能直接导致结果错误。
三、技术方法局限与特殊生物学因素
1、基因突变影响
亲子代之间的基因座可能发生自然突变（概率约 0.1%~0.3%），若检测的 STR 位点中出现 1~2 个不匹配，需通过增加检测位点或计算亲权指数排除突变干扰。若未充分考虑突变，可能误判为非亲子关系。
2、近亲血缘干扰
当疑似父亲与真实父亲为近亲（如兄弟、父子）时，二者基因相似度较高，部分 STR 位点可能出现相同分型，若检测位点数量不足，可能导致亲权指数计算偏差。
3、特殊遗传情况
极少数情况下，嵌合体（个体体内存在两种不同 DNA 型别）、异卵双生融合等特殊遗传现象，可能导致样本中 DNA 分型异常，影响鉴定结果判断。
四、机构资质与流程缺陷
选择无资质的非正规机构，可能存在实验环境简陋、技术人员专业不足、缺乏质量控制体系等问题。例如，使用过时的检测技术（如仅检测 10 个以下 STR 位点），或未进行重复实验验证，会显著增加结果错误的风险。
如何规避风险？
为确保结果准确，需选择具备司法资质的正规检测机构，严格遵循样本采集规范（如司法亲子鉴定需现场采样并拍照留证），避免自行处理特殊样本，同时要求机构提供完整的实验流程报告和基因分型图谱，以便追溯核查。