采用微生物发酵的方法可提高玉米蛋白的可溶性，从而提高其作为饲料的动物消化利用率，促进玉米蛋白质资源的有效利用。

目前微生物发酵饲料常使用的菌种为酵母菌、乳酸菌、芽孢杆菌、链球菌属及部分霉菌等，饲料酵母可产多种动物所需的消化酶，对营养物质的消化吸收起着重要作用，同时酵母菌具有浓烈的酵母香味，对家畜增加食欲增强消化吸收等有一定作用;芽孢杆菌具有较强的淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶活性，可明显提高饲料利用率，还可以消耗大量的氧气，维持肠道厌氧环境，抑制致病菌的生长，维持肠道正常生态平衡，增强机体;

乳酸菌可以提高饲料的品质，并能直接促进动物生长，改善消化道微生态环境，调节消化道免疫系统，具有替代含饲料的潜能。每种菌在发酵饲料中都有不同的功效，因此混合发酵效果要优于单菌发酵