隔代亲属（如祖父母与孙子女）可以做亲子鉴定，但这类鉴定属于亲缘关系鉴定（非直接亲子关系鉴定），与父母与子女间的直接亲子鉴定在技术逻辑、准确率和应用场景上存在差异。
从技术层面来说，隔代亲属鉴定主要通过分析常染色体 STR（短串联重复序列）、Y 染色体标记（祖父与孙子）或线粒体 DNA（祖母与孙女）等遗传标记，计算亲属关系概率。例如，祖父与孙子之间可借助 Y 染色体 STR 标记（Y 染色体呈父系遗传，祖父与父亲、父亲与儿子的 Y 染色体高度一致），结合常染色体标记综合判断；祖母与孙女则可利用线粒体 DNA（母系遗传）辅助分析，再搭配常染色体标记提升准确性。
不过，隔代鉴定的准确率低于父母与子女的直接亲子鉴定。这是因为隔代亲属间的遗传物质传递经过了两代，遗传标记的匹配度会降低，可能出现更多不确定性。比如，孙子女的常染色体一半来自父亲，一半来自母亲，而父亲的常染色体一半来自祖父 / 祖母，因此孙子女与祖父母的常染色体重叠比例约为 25%（理论值），远低于子女与父母 50% 的重叠比例。
在实际应用中，隔代亲属鉴定多适用于特殊场景：如父母一方或双方已故、失踪，无法参与直接鉴定，而需要确认祖父母与孙子女的亲缘关系（如遗产继承、户口登记、寻亲等）。鉴定时，通常需要提供尽可能多的亲属样本（如其他兄弟姐妹、叔伯姑姨等），通过增加遗传标记的比对维度来提高结果的可靠性。
此外，隔代亲属鉴定的结论通常以 “支持存在隔代亲缘关系” 或 “不支持存在隔代亲缘关系” 呈现，而非 “确认” 或 “排除”（直接亲子鉴定的表述），且需要明确说明鉴定的概率值（如累计亲权指数或亲缘关系概率），供委托方或相关部门参考。
总之，隔代亲属可以做亲子鉴定，但需选择具备资质的专业机构，明确鉴定目的和局限性，必要时补充其他亲属样本以提升结果的准确性。