作为大型综合性日报，深圳特区报目前的版面主要包括：要闻、评论、大都会新闻、中国新闻、国际新闻、人文天地、视觉、阅读周刊、理论周刊等，版面结构清晰、完整。采编部门由总编室、大都会新闻编辑部、中国新闻部、国际新闻部、时评理论部、财经编辑部、体育新闻部、文教新闻部、政治新闻部、法制新闻部、经济新闻部、民生新闻部、突发新闻部、区域新闻部、摄影部等部门构成。
截至2021年，深圳特区报干部、职工344人，其中采编人员226人。大学本科以上学历294人，占全部人员总数的85．46％。获正、副高级职称人员33人，占全部人员总数的9．59％。