认证部亦以铁道部产品质量监督检验中心为基础，主要包括业务部、标准协调部、检查检验部、检验协调部和申诉监理部。
CRCC开展的产品认证工作在国家认证认可监督管理委员会的领导下，按专业领域分别受铁路产品认证公正性管理委员会和城轨装备认证工作委员会的公正性监督管理，以及中国认证机构国家认可管理委员会（CNAS）的指导和监督。
CRCC以铁道部标准计量研究所、铁道部产品质量监督检验中心为基础，进行国有资产登记和工商注册，共有工作人员300余人，专兼职检查人员1000余人，分别从事铁道行业的标准计量、产品质检和产品认证工作，配备相对独立的专业工作队伍。
CRCC实行总监责任制，设有综合业务部、机车事业部、基础设施事业部、城市轨道设备事业部、投诉监理部等5个专业部门和相应的后勤保障部门。