制药厂洁净室工程设计注重节能、环保和消防措施。环境工程贯彻于主体工程同时设计、同时施工、同时投产的“三同时”原则。而项目设计不仅要满足项目实施的需要，还要同时为企业的未来发展留有余地。
具体而言，洁净空调系统通常按不同的功能区设计，基本各功能区独立空调，是工程部运行维护的重点，也通过充分的验证及BMS/EMS监控来保障。
纯化水系统中是否一定要配置EDI也可根据生产需求。此外，压缩空气分配系统0.22μm的过滤器的安装位置，分析结果可为动力房等非洁净区用点，该类用点无需经过过滤。
洁净室悬浮微生物法应采用离心式、狭逢式和针孔式等碰击式采样器，采样时间应根据空气中微生物浓度来决定，采样点数可与测定空气洁净度测点数相同。各种采样器应按仪器说明书规定的方法使用。沉降微生物法，应采用直径９０mm培养皿，在采样点上沉降３０mm后进行采样，培养皿少采样数应符合表Ｂ.５.２的规定。
大多数的验收标准是由无尘车间的业主和承建商通过协商，并参考专业无尘车间测试认证公司的建议而达成的协议。由于独立的第三方测试认证公司通常能对于无尘车间的测试提出适合的方案，因此中建南方建议业主和承建商在开始讨论无尘车间的各种技术参数，测试方式和验收标准时就邀请测试认证公司参与。在对有关参数或标准产生分歧时，测试认证公司将以自己的专业知识在业主和承建商之间起到调解人的作用。
我们进行无尘车间气流流型(单向流)的检测,明确无尘车间内的设备或设施对气流的影响,选择或改善气流流型使之产生小的湍流(涡流)，增加无尘车间的自净能力或恢复率，缩短自净时间。在紊流洁净室中，风的输送和混合都是紊流方式进行的。为确保污染物被清楚，无尘车间的各个部分必须均实现良好的空气混合。
气流流形的检测应按以下步骤进行：
1：布置测点：1)垂直单向流无尘车间选择纵、横剖面各一个，以及距地面高度0.8m、1.5m的水平面各一个;水平单向流无尘车间选择纵剖面和工作区高度水平面各一个，以及距送、回风墙面0.5和房间中心处等3个横剖面，所有面上的测点间距均为0.2m~1m；2)乱流无尘车间选择通过代表性送风口中心的纵、横剖面和工作区高度的水平面各一个，剖面上的测点间距为0.2m~0.5m，水平面上测点间距为0.5m~1m。两个风口之间的中线上应有测点。
2：测定方法：用发烟器或悬挂单丝线的方法逐点观察和记录气流流向，并可用量角器量出角度，发烟源可用超声波雾化(0.5um~50um水雾)的去离子(DI)水、喷射方法生成的乙醇或二醇、固态二氧化碳(干冰)等，在高强度光源下示踪。在确保对人和物无伤害时可以四氯化钛(TiCl4)作示踪粒子。