造成木托盘发霉的主要原因有下列几点木托盘木材本身就有大量的微生物附着，木纤维里含有蛋白质、淀粉、油类、纤维素等等都是他们的养料。另外在夏季温度较高的情况下，霉菌繁殖速度快，所以冬天发霉情况少。木材本身湿度，木材在干燥的情况较少发霉，湿度大时容易发霉；周围环境湿度，环境潮湿,适合霉菌生长；周围空气流动性，密闭环境更快速繁殖更容易导致发霉，空气流通好的话会好点。

为了改善木托盘使用中出现的发霉情况，需采取必要的措施来保障其使用质量。这些方法一般有烘干、熏蒸、热处理、防腐、防霉、防潮剂。每一种处理方式都各具特点。就拿烘干来说，这是多数木托盘使用的一种处理方式，此方法可以解决大部分问题，但是成本价格昂贵，并且容易导致木材出现裂纹，如果空气干燥（自然晾干）成本低，但是耗时长。而熏蒸主要是针对出口的木质包装进行杀虫，而且有效期比较短。热处理要有专门的设备，而且处理成本高。

原木材料：目前国内木托盘的材料主要有松木、铁衫、冷杉以及其他杂类硬木，不同的材料代表托盘的不同使用性能。欧洲托盘标准中明确规定不能使用白杨木。

水分含量：托盘原木料的水分含量影响托盘的收缩变形，甚至开裂。应用高标准的托盘对其水分含量指标有严格的控制。欧洲木托盘标准规定水分含量不能超过木材干燥状态时质量的22%，在22%~26%范围内被定义为小缺陷，超过26%即不合格。

木托盘以天然木材为原料制造的托盘。是现在使用广的，因为其价格便宜、结实。

木托盘的清洗方法，首先需要找一个大一点的容器，然后在容器里面放入清洁剂，后将木托盘放进去，浸泡一段时间之后，再用长柄的刷子进行刷洗，刷洗干净之后就要将木托盘上的清洁剂冲刷干净，为了避免木托盘上还会有残留的清洁剂，所以需要将木托盘的正反面都冲刷干净。后将木托盘晾晒干就可以了。