公司年检其主要目的是要审核这些已登记的公司是否合法经营，是否具有继续经营的能力。其中对注册资本的年检是一个相当重要的内容，因为，有否足够的资本是考核企业是否有持续经营能力的一个重要标志。
实质上，注册资本的工商年检是对公司注册资本的一种定期审核，这可在一定程度上防止公司在验资通过后，再来抽逃资金，远比对公司时点资金的验资要可靠的多，这也是为什么要进行工商年检的目的之一。
内资企业代理年检的注意事项:
一、企业应按登记主管机关指定的年检月份参加年检，不得提前办理，逾期年检登记主管机关将按有关法律、法规予以处罚。
二、企业办理年检时，应提交执照正、副本，年检报告书、IC卡（工商企业卡），会计（审计）师事务所出具的年检查帐报告或审计报告，资产负债表和损益表。
三、企业办理年检所提交的文件或材料必须整洁，不得涂抹、删改，应当使用钢笔、毛笔或签字笔填写表格或签字，不得使用圆珠笔。用纸规格必须为16开纸。年检报告书法定代表人应签字。
四、被评为“重合同、守信用单位”的企业，凭市政府颁发的证书，只须提供资产负债表、损益表办理年检。
五、登记主管机关将通过年检的企业，分为两种两类：A级为遵守工商行政管理法规情况良好的；B级为有违反工商行政管理法规行为的。B级企业不得办理增设分支机构和增加经营范围的变更登记，不得投资设立有限公司或股份有限公司。企业未参加年检不得继续从事经营活动。
六、企业办理年检时,如原登记事项（比如住所、法定代表人）等发生变更，应同时办理相关事项的变更登记。